İlker Başbuğ’un aralarında bulunduğu 235 sanık temmuz ayında Ergenekon davasından beraat etmişti.
Yargıtay’ın bozma kararının ardından Ergenekon ana davasına bakan İstanbul 4’üncü Ağır Ceza Mahkemesi, İlker Başbuğ ve 18 sanığın dosyasının görevsizlik kararıyla Anayasa Mahkemesi’ne gönderilmesine karar verdi. Bu kararla, Başbuğ’un Yüce Divan’da yargılanmasının önü açıldı.
Mahkeme, ‘beraat kararı verilip verilmeyeceği değerlendirmesinin’ dahi yüksek görevli mahkemece yapılmasının yerinde olacağını vurguladığı gerekçesinde, “Zira görev hususunun öncelikle değerlendirilmesi zorunlu hususlardan olduğu, görevli olmayan mahkemece yapılan işlemlerin hükümsüz olduğu, bu nedenle olası bir beraat kararının da yüksek görevli mahkemece verilmesinin en doğru olacağı sonucuna varılmıştır” ifadelerine yer vermişti.